Rieka Dyje si tu vyhĺbila hlboké meandrujúce údolie a okolo neho zostal pás divokej prírody, aký sa na južnej Morave inde nenájde. Skalné brality, strmé zalesnené svahy a otvorené vresoviská nad nimi tvoria krajinu, ktorú desaťročia chránila blízkosť štátnej hranice - a práve preto sa zachovala.

Status národného parku dostalo územie v roku 1991. S rozlohou 63 km² ide o najmenší český národný park, čo z neho robí miesto vhodné na pešiu turistiku bez veľkých ambícií - krajina sa dá spoznávať po častiach. Park leží v okrese Znojmo pozdĺž hranice s Rakúskom, kde na neho priamo nadväzuje Národný park Thayatal, takže chránené územie pokračuje aj na druhej strane rieky. Najvyšším bodom je pohraničná Býčia hora s nadmorskou výškou 536 metrov, najnižšie miesto sa nachádza v údolí Gránického potoka vo výške 217 metrov nad morom.

Návštevnícke stredisko funguje v obci Čížov, ktorá býva východiskom pre výlety do vnútra parku, správa parku sídli v Znojme. Kombinácia vinorodého Znojemska a divokého riečneho kaňonu robí z Podyjí cieľ pre tých, ktorí chcú spojiť prechádzku prírodou s poznávaním južnej Moravy.